Visi Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas II Bengkulu yakni Mewujudkan Pintu Masuk Negara dan Wilayah yang bebas penyakit dan faktor risiko
Misi Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas II Bengkulu yakni :
- Meningkatkan deteksi dini dan respon penyakit dan faktor risiko;
- Meningkatkan kualitas kesehatan lingkungan dan alat angkut di pintu masuk negara;
- Meningkatkan tata kelola kegiatan yang bersih dan akuntabel;
- Peningkatan Sumber Data Manusia.